La structure de la Ligue maronite est la suivante:

> L'Assemblée générale:
L'Assemblée générale regroupe l'ensemble des membres adhérents à la Ligue et élit, en un seul tour électoral, le président, le vice-président et le Conseil exécutif.

> Président et vice-président:
Le président et le vice-président de la Ligue sont élus par l'Assemblée générale pour un mandat de trois ans, renouvelable une fois.

> Le Conseil exécutif:
Le Conseil exécutif est élu par l'Assemblée générale pour un mandat de trois ans, renouvelable une fois. Il est composé du président, du vice-président et de quinze autres membres. Le Conseil élit, parmi ses membres, le Secrétaire général et le trésorier de la Ligue.

> Le Comité du Bureau administratif:
Le Conseil exécutif dispose d'un comité du bureau administratif composé du président, du vice-président, du Secrétaire général et du trésorier de la Ligue. Le comité se réunit au moins une fois toutes les deux semaines et lorsque besoin est afin de suivre le fonctionnement de la Ligue et discuter des questions pressantes. Le comité du bureau administratif est également chargé de préparer les réunions du Conseil exécutif.

> Le Cadre administratif:
Le Cadre administratif de la Ligue est fixé par décision du Conseil exécutif et sur proposition du Secrétaire général.

> Les Commissions spécialisées:
La Ligue compte douze commissions spécialisées qui élisent chacune leur président parmi leurs membres. Le Conseil exécutif sélectionne les membres de ces commissions parmi les membres de l'Assemblée générale, pour toute la durée de son mandat.

Les commissions spécialisées de la Ligue sont les suivantes:

1- Comité des affaires politiques et nationales
2- Comité des affaires constitutionnelles et légales
3- Comité des affaires économiques, financières et techniques
4- Comité des affaires des émigrés maronites et libanais
5- Comité des affaires des fonctionnaires et des administrations publiques
6- Comité des affaires éducatives et universitaires, de la Jeunesse et des étudiants universitaires
7- Comité des affaires et des activités sociales, des forums et des cérémonies
8- Comité pour l'environnement et la santé
9- Comité des affaires culturelles, du patrimoine et du dialogue entre les religions
10- Comité de l'information et des médias
11- Comité des affaires et des droits de la femme et de l'enfant
12- Comité de la nationalité libanaise.